Não existe somente uma maneira de ser intersexo. Algumas pessoas intersexo nascem com genitais atípicos, outras nascem com genitais completamente típicos, umas possuem cromossomas XX e possuem naturalmente um pénis e escroto, outras possuem cromossomas XY e possuem naturalmente uma vulva e vagina, entre outras maneiras de ser intersexo. Algumas variações intersexo são visíveis ao nascimento, enquanto outras, não são aparentes até à puberdade. Outras podem inclusive não ser fisicamente aparentes.
Existem diversas variações intersexo, dentre elas:
Disgenesia gonadal parcial (1 em cada 15.000)
Disgenesia gonadal total (1 em cada 150.000)
Eunucoidismo/Hipogonadismo moderado ou severo (20% das pessoas idosas de sexo masculino atribuído)
Hiperplasia adrenal congênita (1 em cada 5.000 a 14.000)
Hipospadia (1 em cada 300 nascimentos)
Mosaicismo envolvendo os cromossomos sexuais
Pseudo-hermafroditismo masculino (1 em 20.000)
Síndrome da insensibilidade androgênica parcial (1 em cada 130.000)
Síndrome da insensibilidade androgênica total (1 em cada 13.000)
Síndrome de Klinefelter (1 a cada 850)
Síndrome de La Chapelle (1 em 20.000)
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